1996年，由原為東京電影新社所屬製作人的小澤十光，於辭職之後創辦了該工作室。創立初期，Brain's Base透過跟漫畫家永井豪密切的關係，以製作改編的OVA起家。1998年，由Brain's Base獨立製作的第一部OVA《真蓋特機器人 世界最後之日》發行。 2000年，Brain's Base第一次獨立製作的動畫電影《看見風的少年 The Boy Who Saw The Wind》上映。 2002年，Brain's Base第一次獨立製作的電視動畫《爆鬥宣言大鋼彈》在電視上播出之後，才全面投入電視動畫製作的行列。 由於Brain's Base初期並沒有自家的攝影和剪接部門。直至2000年代後期才正式開設，調整了公司的製作體制，開始能接受動畫和第二原畫的統包業務。現時有4個製作部門、2個作畫部門和1個攝影、剪接和上色共用的數位部門。旗下製作的經費較其他以中小型企業模式營運的動畫工作室充足。 2013年6月，第三製作部所屬的製作人佐藤由美離社，另外在東京都三鷹市成立「株式會社朱夏」。 2016年，企劃營業製作部所屬的製作人大石祐道離社，並以跟母體企業Brain's Base合作製作《吸血鬼僕人》起家，成立「株式會社Platinum Vision」。
