2005年，日本索尼音樂的旗下企業Aniplex希望更有效發展動畫製作業務，決意成立一間穩定和高品質的公司，A-1 Pictures就此正式成立。公司名稱的由來結合了三個詞：「Aniplex」、「Animation」和「Asagaya」，靈感來源於成為動畫領域第一的願望。 2006年，與另一家動畫公司Noside共同製作的動畫《發條武士》在電視上播出之後，便立即投入獨立製作。同年10月，A-1 Pictures總部遷往在東京都杉並區的阿佐谷工作室。2007年，由A-1 Pictures獨立製作的第一部電視動畫《王牌投手 振臂高揮》播出。 2011年，以偶像為題材的電玩遊戲系列原作的改編作品《偶像大師》於同年7月播出的之後，榮獲『Newtype×Machi☆Asobi動畫獎2011』的CM部門獎、『Newtype×Machi☆Asobi動畫獎2012』的導演獎和腳本獎等7個部門，並擠進排行榜上的前2名。2014年在劇院上映的劇場版獲得了『Newtype×Machi☆Asobi動畫獎2014』的工作室獎和導演獎等6個部門多種獎項。2015年，又再度獲得了『Newtype×Machi☆Asobi動畫獎2015』的工作室獎。同年1月，《偶像大師》推出的另一部電玩遊戲系列原作的改編作品《偶像大師 灰姑娘女孩》的電視動畫播出之後入圍人物設計獎。同時，另一部與TROYCA共同製作的原創動畫《ALDNOAH.ZERO》入圍機械設計獎和音效獎。並達成4冠紀錄的成果。 2012年，同樣位於東京都杉並區的高圓寺工作室正式啟用。 2018年4月1日，高圓寺工作室改名CloverWorks，成為新品牌。同年10月1日，CloverWorks從A-1 Pictures獨立。
