前身「日本動畫有限公司」於1948年1月31日由政岡憲三與山本善次郎在東京成立。名稱於1952年8月更改為「日動映畫有限公司」。其後，它於1956年7月31日被東映有限公司收購，並更名為「東映動畫有限公司，開始製作動畫電影。 1958年製作的日本首部彩色長篇動畫《白蛇傳》，收穫了9.5萬美元，並且出口美國，奠定了日本動畫電影的基礎。 東映動畫時代製作的第一套電視動畫《狼少年肯》於1963年11月25日正式於電視上播映。 1998年10月1日，更名為東映ANIMATION有限公司。
