2000年11月10日，BEE TRAIN的公司代表兼製作人堀川憲司於富山縣東礪波郡城端町成立越中動畫本鋪株式會社。2002年1月1日，公司正式更名為P.A.Works，並緊接把工作室搬至現址。成立的緣由在於堀川需要按家族的約定回歸當地，並有見本土未有任何成熟的動畫工作室，於是決定創業。設立初期曾一度因資金有限而要借用已荒廢的醫院作改建，及借用有線電視的網路去處理各項行政工作。創立以來，公司長期作為BEE TRAIN、Production I.G和BONES作畫協力的合作夥伴之一。 隨著公司業務發展，公司除了有力於首都東京成立分社，亦致力改善員工在健康和宿舍方面的福利。目前富山本社主要負責作畫和3D-CG製作，而東京事務所P-10則負責演出和發行製作的事宜。2008年，公司首次投入獨立製作《真實之淚 true tears》，並藉此定下其早期推展原創動畫，及致力維持成品高品質的路線。同時間，公司亦有投資在《雷頓教授系列》的Q版畫風製作。 P.A.Works早期除了個別作品是以小說和遊戲改編外，基本都以原創動畫為主打，直到2022年以電視動畫《派對咖孔明》開始進軍漫畫改編的領域。
